W Oddziale IOR prowadzone są prace mające na celu opracowywanie podstaw naukowych i praktyczne wdrażanie oraz modernizowanie programów ochrony roślin uprawnych z uwzględnieniem zasad rolnictwa zrównoważonego, metod integrowanych oraz mając na uwadze bezpieczeństwo ludzi i środowiska.
Działalność w zakresie fizykochemii i analityki środków ochrony roślin oraz opracowywanie bezpiecznych metod likwidacji odpadów pestycydowych to ważne elementy działalności statutowej Oddziału stanowiące jego specjalizację.