1.1. Ocena przydatności dostępnych metod do identyfikacji taksonomicznej kwarantannowego nicienia węgorka sosnowca (Bursaphelenchus xylophi-lus) – Kierownik tematu prof. dr hab. Marek Tomalak

1.2. Opracowywanie programów zwalczania stonki kukurydzianej (Diabrotica virgifera Le Conte) w Rzeczypospolitej Polskiej - Kierownik tematu prof. dr hab. Marek Mrówczyński

1.3. Określanie zakresu zmienności morfologicznej i molekularnej nicieni-pasożytów roślin w celu identyfikacji gatunków objętych regulacjami prawnymi - Kierownik tematu prof. dr hab. Stefan Kornobis

1.4. Monitorowanie występowania, diagnostyka oraz zmienność populacyjna nowych wirusów w roślinach gospodarczo ważnych - Kierownik tematu prof. dr hab. Henryk Pospieszny

1.5. Ograniczanie występowania chorób bakteryjnych ziemniaka ze szczególnym uwzględnieniem Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus oraz Ralstonia solanacearum - Kierownik tematu dr Anna Maćkowiak

1.6. Ograniczanie występowania chorób bakteryjnych roślin ze szczególnym uwzględnieniem Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis oraz Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus - Kierownik tematu dr Joanna Kamasa

2.1. Badanie pozostałości środków ochrony roślin w płodach rolnych pobieranych z miejsc ich produkcji, zgodnie ze wspólnotowym programem kontroli Unii Europejskiej - Kierownik tematu prof. dr hab. Bogusław Gnusowski, mgr Anna Nowanka

2.2. Badanie pozostałości środków ochrony roślin w płodach rolnych pobieranych z miejsc ich produkcji i wodzie użytkowanej do celów gospodarczych w ramach krajowego programu kontroli - Kierownik tematu prof. dr hab. Bogusław Gnusowski, mgr Anna Nowacka

2.3. Monitoring pozostałości środków ochrony roślin w materiałach paszowych pochodzenia roślinnego - Kierownik tematu prof. dr hab. Bogusław Gnusowski, mgr Anna Nowacka

2.4. Wykonywanie analiz jakości substancji aktywnych i środków ochrony roślin - Kierownik tematu mgr Stanisław Stobiecki

2.5. Monitoring zagrożenia wokół miejsc składowania środków ochrony roślin - Kierownik tematu dr inż. Kazimierz Waleczek

3.1. Integrowane programy ochrony roślin jako podstawa nowoczesnych technologii produkcji roślin rolniczych - Kierownik tematu prof. dr hab. Marek Mrówczyński

3.2. Aktualizacja istniejących i opracowywanie nowych progów szkodliwości ważnych gospodarczo agrofagów - Kierownik tematu prof. dr hab. Marek Mrówczyński

3.3. Monitoring stanu środowiska w aspekcie opracowywania programów ochrony roślin na terenach objętych oddziaływaniem emisji przemysłowych - Kierownik tematu dr hab. Janusz Rosada

3.4. Opracowywanie metod zwalczania szkodników i chorób roślin w rolnictwie ekologicznym - Kierownik tematu dr Zdzisław Kaniuczak

3.5. Utworzenie i prowadzenie rejestru środków ochrony roślin do stosowania w rolnictwie ekologicznym - Kierownik tematu dr Ewa Matyjaszczyk

3.6. Prowadzenie analiz pozostałości środków ochrony roślin w płodach rolnych, roślinnych produktach spożywczych i paszach pochodzących z produkcji ekologicznej - Kierownik tematu prof. dr hab. Bogusław Gnusowski, mgr Anna Nowacka

3.7. Monitoring i sposoby ograniczania występowania chorób wirusowych roślin uprawnych - Kierownik tematu prof. dr hab. Henryk Pospieszny

3.8. Monitoring i diagnostyka molekularna wirusów zbóż - Kierownik tematu dr hab. Małgorzata Jeżewska

3.9. Adaptacja do polskich warunków, tworzenie nowych i upowszechnianie systemów wspomagających decyzje o ochronie roślin - Kierownik tematu dr hab. Felicyta Walczak

3.10. Modernizacja i aktualizacja metodyk dla prowadzenia monitoringu dla celów krótko i długoterminowego prognozowania agrofagów - Kierownik tematu dr hab. Felicyta Walczak

3.11. Ocena stanu fitosanitarnego i znaczenia gospodarczego najważniejszych agrofagów roślin uprawnych oraz sugestie prognozowe - Kierownik tematu dr hab. Felicyta Walczak

4.1. Monitoring zmian bioróżnorodności w środowisku rolniczym oraz zapobieganie rozprzestrzenianiu się gatunków inwazyjnych (Alien invasive species) - Kierownik tematu prof. dr hab. Jan Nawrot

4.2. Tworzenie programów redukcji ryzyka poprzez systematyczne badanie zagrożeń we wszystkich obszarach ochrony roślin - Kierownik tematu prof. dr hab. Stefan Pruszyński, mgr Stanisław Stobiecki

4.3. Monitoring uodporniania się agrofagów na środki ochrony roślin - Kierownik tematu doc. dr hab. Tadeusz Praczyk

4.4. Prowadzenie kolekcji mikroorganizmów patogenicznych roślin - Kierownik tematu prof. dr hab. Maria Rataj-Guranowska

4.5. Opracowywanie programów i organizacja systematycznego szkolenia służby ochrony roślin, producentów rolnych i ogrodniczych oraz doradców - Kierownik tematu dr Stefan Wolny